Les Communautés ecclésiales anglicanes protestantes au Proche Orient n'ont pas leurs origines dans la région. Elles se sont répandues surtout à partir du XIXe avec l'installation des missionnaires européens et américains. Après un rapprochement d'organisations missionnaires dans les années 1920, elles ont fondé en 1956 un Conseil chrétien du Proche-Orient, première ébauche de ce qui deviendra le Conseil des Églises du Moyen-Orient (CEMO), avec le développement du dialogue avec les Eglises orthodoxes et orientales orthodoxes. Treize Communautés ecclésiales issues de la réforme du XVI° siècle font partie aujourd'hui du CEMO :

1. Église évangélique copte (ou Église évangélique d'Égypte - Synode du Nil)

2. Église évangélique luthérienne de Jordanie et de Terre Sainte

3. Église épiscopale (anglicane) de Jérusalem et du Moyen-Orient :
• Diocèse de Jérusalem
• Diocèse de Chypre et du Golfe
• Diocèse d'Égypte
• Diocèse d'Iran

4. Église épiscopale (anglicane) du Soudan

5. Union des Églises évangéliques arméniennes du Proche-Orient

6. Église évangélique du Soudan

7. Synode de l'Église évangélique en Iran

8. Synode évangélique national de la Syrie et du Liban

9. Union évangélique nationale du Liban

10. Église presbytérienne au Soudan

11. Église protestante en Algérie

12. Église réformée de France en Tunisie

13. Église évangélique nationale du Koweït

Sources : Solidarité Orient, CEMO et Annuaire statistique du Vatican 2007 (pour les données chiffrées qui concernent les Eglises catholiques).